Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC9Q8TBE3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms