Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01545Q5VT33 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms