Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80DQ53TQ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80DQ53TQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms