Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ME3Q16798 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ME3Q16798 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME3Q16798 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME3Q16798 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME3Q16798 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME3Q16798 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ME3Q16798 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME3Q16798 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME3Q16798 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME3Q16798 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME3Q16798 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME3Q16798 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME3Q16798 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ME3Q16798 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME3Q16798 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME3Q16798 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ME3Q16798 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME3Q16798 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME3Q16798 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME3Q16798 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME3Q16798 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME3Q16798 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME3Q16798 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME3Q16798 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME3Q16798 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME3Q16798 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME3Q16798 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME3Q16798 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ME3Q16798 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME3Q16798 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME3Q16798 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME3Q16798 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME3Q16798 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ME3Q16798 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME3Q16798 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME3Q16798 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ME3Q16798 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME3Q16798 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME3Q16798 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME3Q16798 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME3Q16798 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME3Q16798 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME3Q16798 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME3Q16798 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ME3Q16798 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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