Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTDSPL2Q05D32 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms