Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113P62684 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms