Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERPINF1P36955 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms