Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX3O60493 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX3O60493 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX3O60493 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX3O60493 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX3O60493 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX3O60493 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX3O60493 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX3O60493 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX3O60493 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX3O60493 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX3O60493 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX3O60493 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX3O60493 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX3O60493 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX3O60493 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX3O60493 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX3O60493 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX3O60493 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX3O60493 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX3O60493 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX3O60493 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX3O60493 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX3O60493 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX3O60493 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX3O60493 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX3O60493 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms