Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC7A4O43246 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms