Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0S8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0S8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0S8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0S8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0S8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0S8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0S8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0S8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0S8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C0S8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C0S8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C0S8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C0S8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C0S8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C0S8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0S8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0S8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0S8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0S8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0S8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0S8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0S8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0S8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0S8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0S8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0S8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0S8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0S8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0S8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0S8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0S8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0S8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0S8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0S8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0S8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0S8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0S8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0S8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0S8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0S8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0S8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0S8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0S8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0S8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C0S8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C0S8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C0S8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0S8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0S8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0S8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms