Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP69A5D8W1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP69A5D8W1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP69A5D8W1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP69A5D8W1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP69A5D8W1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms