Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQE9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQE9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQE9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
U3KQE9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
U3KQE9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQE9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
U3KQE9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U3KQE9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms