Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQA8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQA8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQA8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQA8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQA8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQA8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQA8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQA8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQA8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQA8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQA8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQA8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQA8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQA8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQA8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQA8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQA8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQA8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQA8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
U3KQA8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
U3KQA8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQA8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQA8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQA8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQA8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQA8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQA8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQA8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQA8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQA8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQA8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQA8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQA8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQA8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQA8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQA8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQA8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U3KQA8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQA8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQA8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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