Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN16Q9Y5I7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN16Q9Y5I7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms