Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR6Q9Y2C9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR6Q9Y2C9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR6Q9Y2C9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR6Q9Y2C9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR6Q9Y2C9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR6Q9Y2C9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms