Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL9Q9P2J3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms