Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK12Q9NYV4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms