Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms