Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC4BQ9NT99 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC4BQ9NT99 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC4BQ9NT99 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC4BQ9NT99 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC4BQ9NT99 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms