Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZCCHC17Q9NP64 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZCCHC17Q9NP64 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms