Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC40A1Q9NP59 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms