Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-8Q9BYQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-8Q9BYQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-8Q9BYQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms