Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms