Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP25Q9BV90 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25Q9BV90 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25Q9BV90 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms