Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM29Q9BSF4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms