Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF2Q99496 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF2Q99496 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms