Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
TOPBP1Q92547 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms