Protein–RNA interactions for Protein: Q86SI9

C5orf38, Protein CEI, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf38Q86SI9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf38Q86SI9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms