Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
WDR88Q6ZMY6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR88Q6ZMY6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms