Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC30Q5VVM6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC30Q5VVM6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms