Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBAP2Q5T6F2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
UBAP2Q5T6F2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms