Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLRC3Q5JS37 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLRC3Q5JS37 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms