Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80DQ53TQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms