Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COL24A1Q17RW2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms