Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK2Q16620 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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