Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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