Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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