Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
EEA1Q15075 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EEA1Q15075 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
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