Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NID2Q14112 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NID2Q14112 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NID2Q14112 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NID2Q14112 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NID2Q14112 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NID2Q14112 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NID2Q14112 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NID2Q14112 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NID2Q14112 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NID2Q14112 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NID2Q14112 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NID2Q14112 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NID2Q14112 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NID2Q14112 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NID2Q14112 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NID2Q14112 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NID2Q14112 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NID2Q14112 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NID2Q14112 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NID2Q14112 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NID2Q14112 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NID2Q14112 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NID2Q14112 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NID2Q14112 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NID2Q14112 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NID2Q14112 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NID2Q14112 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NID2Q14112 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NID2Q14112 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NID2Q14112 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NID2Q14112 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NID2Q14112 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NID2Q14112 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NID2Q14112 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NID2Q14112 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NID2Q14112 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NID2Q14112 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NID2Q14112 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NID2Q14112 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NID2Q14112 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NID2Q14112 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NID2Q14112 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NID2Q14112 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NID2Q14112 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NID2Q14112 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NID2Q14112 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NID2Q14112 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NID2Q14112 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NID2Q14112 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
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