Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARB2Q14108 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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