Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
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