Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBPJQ06330 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms