Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS35P82673 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPS35P82673 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms