Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD10P28358 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms