Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA4P22748 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA4P22748 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA4P22748 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA4P22748 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA4P22748 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA4P22748 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA4P22748 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CA4P22748 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA4P22748 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA4P22748 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CA4P22748 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA4P22748 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA4P22748 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA4P22748 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms