Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms