Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2O75044 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms