Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms