Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3BA8MYP8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms