Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZK1P1A8MUH7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms